细菌性痢疾的预防和其他消化道传染病的预防一样。

首先，要管理好传染源，早期发现患者和带菌者，早期隔离，要积极彻底地进行治疗。

第二，切断传播途径，管理好个人卫生，喝开水不喝生水，用消毒过的水洗瓜果蔬菜和碗筷及漱口。养成饭前便后洗手的良好卫生习惯。

第三，切断传播途径，认真贯彻执行“三管一灭”（即管好水源、食物和粪便、消灭苍蝇）。

第四，保护易感人群，近年来使用志贺菌依链株减毒活菌苗口服，可产生I 醉，以防止痢疾杆菌菌毛贴附于肠上皮细胞，从而防止其侵袭和肠毒素的致泻作用。

也有学者采用X 线照射及氯霉素或亚硝肌诱变等不同方式获得减毒变异株，用于主动免疫，已获初步效果。但总的来说，由于痢疾杆菌的亚型比较多，因此，制成特异性的疫苗难度较大。另外，病愈后机体产生的特异性免疫持续时间也不长，因此，最重要的预防措施还是切断传播途径。