肛乳头轻度增生肥大，患者不会有什么异常感觉。当肛乳头增生肥大到1厘米大小时，部分患者会有肛门内异物感或无法形容的不适感，也有患者感到肛门潮湿、瘙痒，这是炎症刺激，肠液分泌旺盛，从肛门溢出，刺激肛周皮肤所致。还有部分患者可能是不敏感的缘故，没有明确的临床症状。当肛乳头肥大到一定程度后排便时可脱出肛门外，患者可以感觉到，也能用手触摸到，可以引起轻度疼痛，部分脱出的乳头可以自行还纳，有些则需用手推回肛门内。由于肛乳头肥大常与痔相伴生，二者互相影响，故肛乳头肥大也常引起痔疮发作，导致肛缘外痔的水肿、发炎而剧痛，或者肥大的乳头与内痔一起脱出，因肥大的乳头妨碍内痔的回纳，导致内痔嵌顿而痛。