新生儿容易发生肛周脓肿，有些专家分析原因如下：

1、新生儿肛窦损伤感染是肛门直肠周围脓肿的主要原因，肛腺管开口于肛窦，肛窦的开口向上呈漏斗状，肛腺管则直接通向肛门直肠周围间隙中，所以粪便、异物、炎性分泌物及各种细菌非常容易进入肛窦引起肛窦炎和肛腺管炎症，导致肛门直肠周围感染形成。肛窦炎，这是新生儿常见病之一，也是新生儿形成肛瘘最主要的原因。

2、小儿肛门周围尿布皮炎，致使毛囊、汗腺、皮脂腺感染，导致皮下脓肿。加之婴儿免疫机能低、抵抗力差，皮脂腺相对分泌旺盛，也易导致肛周皮下感染，形成脓肿。这种病儿比健康的新生儿(免疫力弱、尚未成熟)的抵抗力还差，易发生败血症和局部感染。

3、全身或邻近肛门处化脓性感染，可以并发肛周感染。有人认为有些新生儿雄性激素分泌过多，刺激肛周皮脂腺，使其分泌旺盛导致继发感染。

4、先天性肛瘘，有专家认为是胎儿阶段直肠阴道隔发育异常所致，特别是女孩直肠前庭瘘和直肠阴道瘘很可能在小儿出生时已存在，而于生后表现症状。

5、偶见因外伤包括肛门直肠手术后继发肛周感染，最后形成肛瘘。

6、其它，包括肿瘤破溃、性病感染等。