肛门尖锐湿疣表现为在肛门周围生长有菜花状或乳头状的赘生物，有的赘生物顶端分叉呈毛刷样，初起时多为米粒大小的灰白色乳头状隆起，数目多少不等，分布也不均匀，患者可以无任何临床症状和不适，只是在排完大便后擦拭肛门时才被发觉。肛门尖锐湿疣生长速度非常快，一周左右即可密密麻麻融合成片，呈苍白色、褐色或褐黑色，触之瘤体不及痔组织柔软，有隔着几层布摸石头的感觉。成片生长时瘤体湿润，可有糜烂、渗出，触之如豆腐渣，易出鲜血，有轻度的疹痒，一般无痛感。

在肛门部还可以生长其他一些与尖锐湿疣类似的赘生物，但它们的生长速度远逊于尖锐湿疣，通过询问病史一般可以鉴别。