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影像学检查主要包括腹部超声波、腹部平片、x射线计算机体层摄影(cT)以及磁共振成像(MRI)等。超声检查主要应用于大肠良性肿瘤和恶性肿瘤的检查，即确定结、直肠占位病灶侵犯的深度，同时可以探测腹部脏器尤其是肝脏是否有癌症转移的可能。经直肠超声波则可诊断直肠癌侵犯的深度和周边是否有淋巴结病变存在，从而对于指导手术治疗具有重要意义。肛管及直肠内超声检查则用来对肛管直肠脓肿的脓腔定位。肛管、直肠及结肠CT检查在大肠肿瘤的诊断和治疗上有独特价值。CT不仅能显示肠管内病变，更重要的是可直接观察到肠壁及其附近的组织和器官。同时CT检查可显示先天性肛门直肠畸形的结构形态及其发育情况有无特异性，有助于手术方式的选择。MRI对大肠恶性肿瘤的早期发现、正确分期以及术后复查有重要诊断价值。在先天性肛门直肠畸形的手术前评价及指导手术方式有重要意义。