直肠性便秘是指粪便早已到达直肠，但由于神经反应迟钝，直肠黏膜牵张感受器敏感性减弱不能引发便意，致使食物残渣在直肠停留过久而未被排出，导致粪便堆积于乙状结肠所致的便秘。多发生在无正常排便习惯、痔疮、肛裂以及经常灌肠者。

直肠性便秘者，其粪块坚硬粗大，量多，干便后还有软便，直肠指诊发现直肠腔扩大。如进食太少、水分缺乏或食物缺乏纤维素、缺乏定时解大便的习惯而影响排便反射也可导致便秘。其他如引起副交感神经活动抑制的脊髓病变，铅、砷、汞和磷等中毒，肠蠕动减弱、直肠黏膜充血、炎症、肛裂、痔疮等，均可引起便秘。肛裂者有直肠性便秘，由于大便干燥坚硬，会使肛裂加重。