根据排便次数减少，粪便干结难解，诊断便秘并不困难。但要明确便秘的原因，除仔细询问病史、症状和作全身体格检查外，尚需作如下检查。

(1)粪便检查：便秘的病人首先应该做粪便检查。检查者应争取对患者一次排出的粪便作目测，粗略估计其重量，观察其物理性状。粪便常规及隐血试验是常规检查内容，应仔细观察粪便的形状、数量、大小、硬度、有无脓血和黏液等。在直肠型便秘时，由于商肠平滑肌松弛，粪便多呈坚硬块状。直肠黏膜有继发性炎症时，粪便带有黏液血丝，如宿便性溃疡、慢性直肠炎等。粪便变细、变桶，多为肛门括约肌痉挛引起，但持续变细时则要考虑直肠癌或直肠狭窄。粪便呈坚硬小块，状如羊粪，多为痉挛性便秘。结肠过敏除羊粪状便外，常有多量黏液、粪结气臭、色黄，多是实热内结，粪结味臭、色黑，多是津少血燥。镜检发现虫卵可能由寄生虫所致。

(2)血常规检查：血常规有贫血，周围血液中有网织、点彩红细胞与多染色细胞增多，多为慢性铅中毒。血、尿含铅量的测定，也有助于铅中毒的诊断。

(3)血生化检查：主要针对可导致便秘的内分泌、代谢性因素进行检查。近年来，胃肠道激素与便秘的关系引起了人们的注意，国外学者已做了一些工作，但结论尚未明确，国内这方面的工作还做得较少。

(4)直肠指诊：手指活动自如灵活，对接触物感觉敏锐，对直肠、肛门、前列腺、子宫颈体处细微的硬结、溃疡、息肉、瘢痕等能敏感触及，有时甚至能够得到比内窥镜X线等检查更为准确的资料，对诊断和治疗便秘颇有价值。直肠指诊能准确判定直肠内宿便和坚硬粪块填塞、直肠异物、外来压迫等，能发现直肠癌症、直肠狭窄、直肠腔扩大、肛门括约肌松弛、肛门紧缩，并常用于粪便的嵌顿刮除等。

(5)内窥镜检查：包括肛门直肠镜、乙状结肠镜、纤维肠镜等内窥镜检查，主要目的是排除肿瘤性病变。长期灌肠，尤其是用肥皂水灌肠者，可见结肠黏膜水肿、血管纹理不清。长期服用蒽醌类泻者，可见黏膜黑变，其颜色从浅褐色至黑色不等。便秘伴有出血、黏液便，怀疑有实质性病变时，应做内窥镜检查。估计病变位置，选用肛门直肠镜、乙状结肠镜、纤维肠镜等检查，可用于证实直肠指诊的发现，供以观察肠黏膜是否存在病变，并可做活组织检查，以明确病变性质。检查时，应事先做清洁灌肠或使用开塞露排空。

(6)X线检查：可根据病情选用钡餐或钡灌肠X线检查。钡餐适用于全胃肠道检查，借以了解钡通过时间及小肠、大肠的功能状态。钡灌肠适用于观察结、直肠的形态及发现病变。正常时，钡刹在12～18小时内可达到结肠脾曲，24～72小时内应全部从结畅排出。便秘时可有排空延迟。钡剂灌肠特别是结肠低张双重造影，对发现便秘的病因可能有帮助。钡灌肠是诊断结肠器质性病变的主要方法之一，可发现冗长结肠、结肠增宽。如在侧位片上，骨盆人口处乙直肠宽度超过6.5 cm，可认为异常。

(7)特殊检查：吞服一定数量不透X线的胶管碎片作为标志物，定时拍摄腹片，可了解到标志物在胃肠道内运行的速度及分布情况，以区分直肠性便秘或结肠性便秘。如为直肠性便秘，可见标志物在结肠中运行很快，最后聚集于直肠。如为结肠性便秘，则标志物分布于空肠与直肠之间。

(8)组织学检查：疑为先天性巨结肠时，应进行活检。过去常在齿上方2～3 cm取材，但有人认为取材以在齿线以上1～1.5 cm为好，因过高部位的取材可能遗漏“超短段巨结肠”。