(1)肠道规律性排便的生理基础是肠道规律性运动，包括合适的强度、节律与方式以及时间。某些yao 物或作用于支配胃肠道运动的神经，将其抑制，或作用于胃肠道肌肉收缩机制的不同环节，使肌肉"软瘫"。

(2)yao 物促进肠内容物中水分的吸收，它们或使水分进人体内，或水分被yao 物吸收，水分少了，粪便干结，对肠道的刺激削弱了，从而引起便秘。

(3)正常菌群平衡的破坏。正常排便需要肠道内有一个平衡的菌群，占绝对优势的有益菌群(如双歧杆菌等)与有害菌(如梭状芽孢菌)之间种类、数量的平衡(不是均等)。一些yao 物，尤其是抗生素类yao 物，可以破坏这种生态平衡，抑制了有益菌，以致有害菌猖獗，也可导致便秘。