南宁医博医院专家指出：肛瘘通常是由肛门直肠周围脓肿引起，而肛周脓肿则大部分是由于肛门腺感染引起。肛瘘大多是非特异性感染，少数是结核性的，其内口位于齿线附近，外口位于肛门周围皮肤上，长年不愈。

可引发肛瘘的疾病有：

（1）肛门周围脓肿：

是引起肛瘘的主要原因。据南宁医博医院专家介绍，患了肛周脓肿，若脓肿延误了早期手术治疗，则感染灶就很可能向周围附近间隙转移，形成范围较大的脓肿。脓液可从皮下蔓延到坐骨直肠窝，从患侧经组织间隙蔓延到对侧，又可经内外括约肌之间进入肛门内，向上穿破提肛肌进入盆腔形成腹膜炎，或向邻近组织器官如直肠、膀胱、阴道、尿道等侵蚀溃烂穿破，形成多种类型的复杂性肛瘘。

（2） 直肠肛门损伤：

外伤、来自消化道的骨性异物、金属、肛表及肛门窥器检查损伤肛管直肠，细菌侵入伤口即可引起肛门周围脓肿，一般发生在非专业医院。

（3） 肛裂：

肛裂反复感染，可引起皮下瘘，也可引起肛腺炎。

（4）直肠肛管癌：

常伴发肛瘘。