肛瘘为什么难以自愈？肛瘘难以自愈，仅仅单纯作脓肿切开手术，而不作根治手术容易复发，究其原因可能有以下一些：

（1）内口的存在。脓肿虽然破溃或已切开引流，但原发感染源如肛窦炎或肛腺感染依然存在，肠腔内容物还可从内口继续进入瘘管。

（2）肛门部不能静养，脓腔不易粘合，排粪、排尿时，因括约肌收缩或因炎症刺激肛门括约肌，使肛门括约肌经常处于痉挛状态。

（3）肠腔中的压力高于外界，所以粪便、肠液和气体持续进入瘘管，刺激管壁，使管壁结缔组织增生变厚，管腔难以闭合。

（4）脓腔引流不畅，或外口缩小，时闭时溃，脓液蓄积腔内，导致脓肿再发并穿破而形成新的支管或瘘道。

（5）管道多在不同高度穿过肛门括约肌，括约肌收缩阻碍脓液排出，以致引流不畅。